Neben einer hohen Artenvielfalt zeichnen sich Biodiversitätshotspots dadurch aus, dass hier Arten vorkommen, die nirgendwo sonst auf der Welt zu finden sind. Diese sogenannten endemischen Arten finden sich meist in isolierten Gebieten, an deren Bedingungen sie sich über lange Zeit angepasst haben.

In Indo-Burma liegen solche Rückzugsgebiete vor allem in Gebirgen (wie den oben genannten Gebirgszügen), in Karstlandschaften, auf Inseln wie Hainan und die Andamanen-Inseln sowie in isolierten Waldgebieten wie den Trockenwäldern im Zentrum Myanmars.

Das Aushängeschild des Biodiversitätshotspots ist eine solche einzigartige Art — das Saola. Es wurde erst 1992 in den abgelegenen Wäldern des Truong-Son-Gebirges entdeckt und seitdem nur wenige Male gesehen. Obwohl es aussieht wie eine Antilope, ist es näher mit den Rindern verwandt. Aufgrund seiner Seltenheit gilt die Art als vom Aussterben bedroht.

In denselben Regenwäldern leben auch weitere außergewöhnliche Arten wie das Annamitische Streifenkaninchen, die Laotische Felsenratte (der einzige Vertreter einer ganzen Familie von Nagetieren) und das Annam-Muntjak. Am südlichen Ende des Truong-Son-Gebirges, findet sich noch ein weiterer ungewöhnlicher Bewohner: Vampyrius vampyrus, eine endemische Flugfroschart. Ihren Namen verdankt sie seinen Kaulquappen: sie besitzen kleine Fangzähne, mit denen sie vermutlich die unbefruchteten Eier ihrer Mutter fressen.

Am entgegengesetzten Ende des Hotspots, in den Karsthöhlen der Hochländer zwischen Myanmar und Thailand, findet sich das kleinste Säugetier der Welt. Mit gerade einmal drei Zentimetern Körperlänge und zwei Gramm Gewicht ist die Schweinsnasenfledermaus kaum größer als eine Hummel — daher kommt ihr englischer Name bumblebee bat.

Wie in den Gebirgen, nur in kleineren Maßstab, finden sich auch in den zahlreichen Karstlandschaften Indo-Burmas viele endemische Arten. Denn diese Formationen aus Kalkstein sind wie Inseln — nur an Land. Unterschiedliche Tier- und Pflanzenarten haben sich dabei an einzelne Felsen angepasst und leben seitdem isoliert voneinander. Deshalb kommen zum Beispiel Arten wie die Delacour-Schwarzlanguren nur auf wenigen Karstfelsen in Nordvietnam vor.

Die größte und bedeutendste Karstlandschaft Indo-Burmas ist dabei der Korridor zwischen Vietnam und China. In diesen schwer zugänglichen Landschaften leben einige seltene Arten die Tonkin-Stumpfnase, der Östliche Schwarze Schopfgibbon oder die Trung Khanh-Grubbenotter.

Auch die Trockenwälder in Myanmars Zentralregion bilden ein solches Rückzugsgebiet und sind ein Kontrast zu den Regenwäldern des Hotspots. In dieser von Dürre geprägten Landschaft leben spezialisierte Arten wie die Kapuzenbaumelster und die stark bedrohte Birma-Sternschildkröte, die sich an das trockene Klima angepasst haben.

Neben den einzigartigen Arten, die sich an ihre Isolation angepasst haben, gibt es noch einen weiteren Faktor, der Indo-Burma besonders macht. Und der verbirgt sich unter der Wasseroberfläche.